Управление учебным центром осуществляет акционерное общество «Центральная геофизическая экспедиция» в соответствии с законодательством Российской Федерации на основе принципов единоначалия и коллегиальности.

Высшим коллегиальным органом управления АО «ЦГЭ» является Совет директоров. Единоличным исполнительным органом управления – управляющий директор, который осуществляет текущее руководство деятельностью АО «ЦГЭ», Закиржанов Ильдар Габдулвалеевич.

Руководитель учебного центра – начальник службы охраны труда, окружающей среды и промышленной безопасности Кузмичев Евгений Викторович.